ক্রোমোজোম কনফরমেশন ক্যাপচার (3C)-ভিত্তিক পদ্ধতি ক্রোমাটিন বরাবর বিন্দুর দৈহিক নৈকট্য নির্ধারণ করে নিউক্লিয়াসের মধ্যে ক্রোমোজোম সংগঠন প্রকাশ করে। তারা ক্রস-লিঙ্কিং দ্বারা ক্রোমাটিন মিথস্ক্রিয়া সংরক্ষণ করে এবং তারপরে ফ্র্যাগমেন্টেশন, লাইগেশন এবং ইন্টারঅ্যাক্টিং অঞ্চলগুলির সিকোয়েন্সিং করে।
ক্রোমোজোম কনফর্মেশন ক্যাপচার কিভাবে কাজ করে?
ক্রোমোজোম কনফরমেশন ক্যাপচার-অন-চিপ (4C) একটি অবস্থান এবং অন্যান্য সমস্ত জিনোমিক অবস্থানের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া ক্যাপচার করে। এটি একটি দ্বিতীয় বন্ধন ধাপ জড়িত, স্ব-বৃত্তাকার ডিএনএ টুকরা তৈরি করতে, যা বিপরীত পিসিআর সম্পাদন করতে ব্যবহৃত হয়। … একটি মাইক্রোয়ারে, আনুমানিক এক মিলিয়ন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করা যেতে পারে৷
ক্রোমাটিন কনফর্মেশন ক্যাপচার কি?
ক্রোমাটিন কনফরমেশন ক্যাপচার (3C) হল ক্রোমাটিন গঠন অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত একটি গুরুত্বপূর্ণ কৌশল, সেইসাথে অন্যান্য বেশ কিছু ডেরিভেটিভ কৌশলগুলির ভিত্তি। … প্রোটোকলের মধ্যে রয়েছে কোষের ফর্মালডিহাইড ক্রস-লিঙ্কিং এর পরে ক্রোমাটিন বিচ্ছিন্নতা এবং একটি সীমাবদ্ধ এনজাইম দিয়ে হজম হয়।
হাই-সি সিকোয়েন্সিং কিভাবে কাজ করে?
Hi-C পন্থা 3C-Seq ক্রোমাটিন পরিচিতি জিনোম-ব্যাপী ম্যাপ করতেপ্রসারিত করে, এবং এটি সিটু ক্রোমাটিন মিথস্ক্রিয়ায় অধ্যয়নের জন্যও প্রয়োগ করা হয়েছে। এই পদ্ধতিতে, ডিএনএ-প্রোটিন কমপ্লেক্সগুলি ফর্মালডিহাইডের সাথে ক্রস লিঙ্ক করা হয়। নমুনাটি খণ্ডিত, এবং ডিএনএ নিষ্কাশন করা হয়, বন্ধন করা হয় এবং সীমাবদ্ধ এনজাইম দিয়ে হজম করা হয়।
Hi-C কৌশল কি?
ক্ল্যাসিকাল হাই-সি কৌশলটি একটি ফর্মালডিহাইড ক্রস-লিঙ্কড জিনোমের ক্রম-নির্দিষ্ট সীমাবদ্ধতা এনজাইমগুলির সাথে সীমাবদ্ধতা হজম করে, তারপরে এর অন্তর্ভুক্তির সাথে হজমকৃত প্রান্তগুলি পূরণ এবং মেরামত করে। বায়োটিন-সংযুক্ত নিউক্লিওটাইডস। মেরামত করা প্রান্তগুলি আবার বন্ধ করা হয়৷
